MatsuLab. Lecture Note/sougouenshu2007

第1ラウンド解説 †

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日程 †

基本木曜日。月曜も研究室にいるので、質問があったら来てください。

11/1（木）15:00〜松岡先生が研究室の紹介をしてくださる予定です。

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第1回目 †

10/4

課題
渡したMPI仕様書を読んで、どういった通信関数があるか調べて簡単にまとめてくること。 主に一対一通信、集団通信の2グループに分かれるが、それぞれに多くの通信関数が提供されているので、関数の特徴をまとめてくること

ヒント
一対一通信

集団通信

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第2回目 †

10/11

課題確認

クイズ

MPIを使った並列プログラミング

基本

MPIアプリケーションと、サーバ・クライアント型アプリケーションの違い

MPIプログラムのサンプル
添付ファイル mpi_pi.c を参考。 このファイルはモンテカルロ法を用いてPIを計算する、本当に初歩的なMPIプログラム。 MPI関数もMPI_BcastとMPI_Reduceしか用いていず、1関数での通信量も高々4バイト。

mpi_pi.cのコンパイル＆実行方法

$ mpicc -c mpi_pi.c
$ mpicc -o mpi_pi mpi_pi.o -lm
$
$ mpirun -np 2 -machinefile machines ./mpi_pi  <- 実行

課題

その1 mpi_pi.cにおいて、定数N_POINTSや実行するプロセス数をさまざまに変化させて、実行時間を確認すること。

その2 以下の指示に従い「行列とベクトル積を行なうプログラム」を実装し、実行すること。 シングルプロセッサ用プログラムを用意してあるので、それを参考にして良い。

シングルプロセッサ用プログラムのコンパイル＆実行方法

$ gcc -c vector.c    <- vector.oが既に生成されていれば実行しなくても良い
$ gcc -c mul_matrix.c
$ gcc -o mul_matrix mul_matrix.o vector.o
$ ./mul_matrix    <- 実行

MPIプログラム（例 mpi_mm.c）のコンパイル方法

$ gcc -c vector.c    <- vector.oが既に生成されていれば実行しなくても良い
$ mpicc -c mpi_mm.c
$ mpicc -o mpi_mm mpi_mm.o vector.o
$ mpirun -np 4 -machinefile machines ./mpi_mm   <- 実行
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課題の進め方 †

その1

その2

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松岡研PCクラスタPrestoIIIの使い方 †

作業には基本的にターミナルを使用する

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参考文献 †

  1. MPIドキュメント集
    • 初回配布資料は、この文献の前半部分（140ページまで）
  2. TSUBAMEの構成
  3. MPIによる並列プログラミングの基礎(PDF)
    • 同志社大の先生が書かれた、非常に詳しい日本語資料
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